Não há perda de matéria ela segue a Lei de Lavoisier "nada se perde, nada se cria, tudo se transforma".

O que ocorre é que durante a reação química de transformação do álcool em vinagre os gases formados  se perdem na atmosfera porque o recipiente está aberto.
O ácido acético é muito volátil e parte do que está sendo formado flui para a atmosfera, causando a diminuição da massa inicial.
É a mesma coisa que ocorre ao colocar água na fervura, após algum tempo vemos que o seu volume diminuiu, a água não se perdeu, apenas transformou-se em vapor e fluiu para a atmosfera.

Reação: C2H5OH+O2 --> CH3COOH + H2O