O metabolismo é ineficiente e produz calor. Os seres endotérmicos usam o calor metabólico para manter uma temperatura corporal estável, enquanto ectotérmicos não o fazem.

A taxa de metabolismo "padrão" de um animal é medida como a taxa metabólica basal (TMB) para um endotérmico ou como a taxa metabólica padrão (TMP) para um ectotérmico.

Entre endotérmicos, os animais menores tendem a ter taxas metabólicas basais por grama mais altas (metabolismo "mais quente") que os animais maiores. O mesmo é verdadeiro entre ectotérmicos, apesar de não se poder comparar os grupos.

A taxa metabólica varia com o nível de atividade. Animais mais ativos têm uma taxa metabólica mais alta do que animais menos ativos.

Alguns animais entram em um estado de torpor no qual seu metabolismo diminui. Hibernação no inverno e estivação no verão são formas de torpor.