A primeira lei da termodinâmica fala da conservação da energia, a energia não se cria nem se destrói só se transforma.

A segunda lei da termodinamica fala sobre a entropia que é o grado de desordem de um sistema, todos os sistemas tendem irreversivelmente ao desordem. No exemplo que você apresenta a entropía que  é produzida e liberada ao medio é bem maior em comparação  com a disminução  de entropía qproduzida na planta para lograr o ordem interior dentro do sistema  (enquanto ela vai se desenvolvendo).   Então a entropía vai em aumento,  devido a isso  os organismos não podem preservar o ordem de seus corpos, e morem e seus corpos  decompõem-se.