No link abaixo você pode escolher um programa gerador de palavras cruzadas para baixar no computador (a maioria é gratuita para testar).
Já usei o crossword compiler: nele você digita uma lista de palavras (no seu caso, relacionadas ao sistema nervoso) e o programa monta a cruzadinha, que seria a solução do passatempo. A única coisa que se deve elaborar são as perguntas (cujas respostas são as palavras da lista que você digitou):
 http://www.baixaki.com.br/busca/?q=crossword+compiler&so=1&buscar=

Ex.: 1- Célula nervosa especializada dos vertebrados
       resposta: Neurônio ⇒ essa é a palavra que deve ser digitada na lista do programa

Espero ter ajudado.