Há mais probabilidade de ocorrerem problemas com a digestão retirando o duodeno. Isto porque o duodeno é uma parte do intestino delgado, onde o organismo dá continuidade na digestão que começou na boca, passou pelo estômago, e agora finaliza no intestino delgado. No intestino grosso, é apenas uma finalização do processo, onde somente água é reabsorvida. Portanto, traria problemas maior se retirássemos o duodeno.