A proto cooperação é uma relação entre duas espécies na qual ambas são beneficiadas. Porém, uma pode viver independente da outra. Um exemplo disso é o Caranguejo Bernardo-Eremita (paguro) que serve de meio de trasporte para a Anêmona, que por sua vez protege o Paguro contra o ataque de predadores devido a substâncias urticantes encontradas em seus tentáculos. 
Mutualismo é a interação de duas espécies que se beneficiam reciprocamente, mas, ao contrário da proto cooperação a coexistência é indispensável para a sobrevivência. O mutualismo é uma relação em que ambas as espécies são beneficiadas.