Basicamente estes agentes antimicrobianos podem ser conceituados como compostos produzidos por microrganismos que possuem atividade antimicrobiana bactericida ou bacteriostática. Devem ser diferenciados das bacteriocinas que também são produtos do metabolismo secundário de microrganismos. As bacteriocinas (peptídios) variam entre as bactérias e a atividade antimicrobiana destes compostos é ainda pouco conhecida. Não são utilizados usualmente no tratamento de doenças infecciosas por serem tóxicas. Atualmente existem pomadas apenas para uso tópico.